Vid två års ålder får Jake diagnosen svår autism och hans föräldrar får höra att han aldrig ens kommer att lära sig att knyta skorna, än mindre lära sig läsa och skriva.

Det visar sig att Jake har ett mycket högt IQ, ett fotografiskt minne och på egen hand lär sig matematisk analys. Redan nio år gammal arbetar han med en egen teori i astrofysik, och vid tolv års ålder är han en avlönad forskare i kvantfysik.

Gnistan är en sann historia skriven av e mamma om sin son. Trots att de är omgivna av experter så går hon sin egen väg vad gäller sonen. Hon ser vad han kan - och inte vad han inte kan. Hon väcker "gnistan" inom Jake och kämpar för att han ska få utveckla de färdigheter han har. De visar sig vara större än vad någon kunnat ana.